Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atl3Q91YH5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atl3Q91YH5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atl3Q91YH5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms