Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm2Q91YD4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm2Q91YD4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms