Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Basp1Q91XV3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms