Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trex1Q91XB0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trex1Q91XB0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms