Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trub2Q91WG3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trub2Q91WG3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms