Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubtd1Q91WB7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubtd1Q91WB7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms