Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms