Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csde1Q91W50 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csde1Q91W50 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms