Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd3Q91W18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd3Q91W18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms