Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H1fooQ8VIK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms