Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParnQ8VDG3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ParnQ8VDG3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParnQ8VDG3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms