Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sgip1Q8VD37 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sgip1Q8VD37 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms