Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc18Q8VD24 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc18Q8VD24 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms