Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top1mtQ8R4U6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Top1mtQ8R4U6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top1mtQ8R4U6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top1mtQ8R4U6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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