Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip5Q8R361 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11fip5Q8R361 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11fip5Q8R361 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms