Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms