Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2A5

Vmn1r225, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r225Q8R2A5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r225Q8R2A5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r225Q8R2A5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms