Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r200Q8R281 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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