Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z5

Sf3a1, Splicing factor 3A subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a1Q8K4Z5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a1Q8K4Z5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a1Q8K4Z5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms