Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc5Q8K4Z2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc5Q8K4Z2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc5Q8K4Z2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc5Q8K4Z2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc5Q8K4Z2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc5Q8K4Z2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc5Q8K4Z2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms