Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Colec12Q8K4Q8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms