Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxn4Q8K3Q3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms