Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms