Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk5rap2Q8K389 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk5rap2Q8K389 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms