Protein–RNA interactions for Protein: Q8K304

Tmem129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem129Q8K304 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem129Q8K304 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem129Q8K304 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms