Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paf1Q8K2T8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms