Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brd3Q8K2F0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms