Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkd3Q8K1Y2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkd3Q8K1Y2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms