Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nek9Q8K1R7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek9Q8K1R7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms