Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sde2Q8K1J5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms