Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Habp2Q8K0D2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Habp2Q8K0D2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms