Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago4Q8CJF8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago4Q8CJF8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ago4Q8CJF8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms