Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mterf1aQ8CHZ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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