Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ep400Q8CHI8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ep400Q8CHI8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms