Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc8Q8CFD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms