Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkiras1Q8CEC5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkiras1Q8CEC5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms