Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef8Q8CE24 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.5 ms