Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms