Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms