Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms