Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slfn5Q8CBA2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slfn5Q8CBA2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms