Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe22Q8C6A8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms