Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssuh2Q8C3L1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssuh2Q8C3L1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms