Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska3Q8C263 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska3Q8C263 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska3Q8C263 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska3Q8C263 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska3Q8C263 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska3Q8C263 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms