Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip1Q8C079 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip1Q8C079 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms