Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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Cldn17Q8BXA6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Cldn17Q8BXA6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn17Q8BXA6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn17Q8BXA6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms