Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sall4Q8BX22 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall4Q8BX22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms