Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp38Q8BW70 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Usp38Q8BW70 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Usp38Q8BW70 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Usp38Q8BW70 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp38Q8BW70 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp38Q8BW70 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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