Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Triml1Q8BVP1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms