Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod1Q8BVA4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmod1Q8BVA4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms